Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms