Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
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Abcc1O35379 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
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Abcc1O35379 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
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Abcc1O35379 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
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Abcc1O35379 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
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Abcc1O35379 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
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