Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Srsf5O35326 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms