Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NmiO35309 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NmiO35309 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NmiO35309 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NmiO35309 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NmiO35309 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NmiO35309 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NmiO35309 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NmiO35309 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NmiO35309 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NmiO35309 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NmiO35309 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NmiO35309 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NmiO35309 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NmiO35309 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NmiO35309 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NmiO35309 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NmiO35309 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NmiO35309 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NmiO35309 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NmiO35309 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NmiO35309 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NmiO35309 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NmiO35309 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NmiO35309 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NmiO35309 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NmiO35309 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NmiO35309 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NmiO35309 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NmiO35309 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NmiO35309 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NmiO35309 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NmiO35309 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NmiO35309 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NmiO35309 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NmiO35309 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NmiO35309 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NmiO35309 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NmiO35309 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NmiO35309 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NmiO35309 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NmiO35309 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NmiO35309 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NmiO35309 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NmiO35309 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NmiO35309 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NmiO35309 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NmiO35309 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NmiO35309 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NmiO35309 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NmiO35309 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NmiO35309 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NmiO35309 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NmiO35309 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NmiO35309 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NmiO35309 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NmiO35309 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NmiO35309 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NmiO35309 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NmiO35309 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NmiO35309 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NmiO35309 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NmiO35309 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NmiO35309 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NmiO35309 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NmiO35309 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NmiO35309 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NmiO35309 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NmiO35309 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NmiO35309 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NmiO35309 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NmiO35309 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NmiO35309 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NmiO35309 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NmiO35309 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NmiO35309 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NmiO35309 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NmiO35309 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NmiO35309 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NmiO35309 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NmiO35309 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NmiO35309 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NmiO35309 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NmiO35309 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NmiO35309 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NmiO35309 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NmiO35309 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NmiO35309 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NmiO35309 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NmiO35309 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NmiO35309 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NmiO35309 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NmiO35309 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NmiO35309 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NmiO35309 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NmiO35309 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NmiO35309 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NmiO35309 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NmiO35309 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NmiO35309 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms