Protein–RNA interactions for Protein: O35226

Psmd4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd4O35226 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmd4O35226 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd4O35226 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms