Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms