Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad6O35182 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad6O35182 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad6O35182 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad6O35182 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad6O35182 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad6O35182 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad6O35182 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad6O35182 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad6O35182 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms