Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Polr1aO35134 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms