Protein–RNA interactions for Protein: O35130

Emg1, Ribosomal RNA small subunit methyltransferase NEP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emg1O35130 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emg1O35130 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emg1O35130 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emg1O35130 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emg1O35130 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emg1O35130 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Emg1O35130 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Emg1O35130 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms