Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArxO35085 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArxO35085 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ArxO35085 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArxO35085 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArxO35085 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArxO35085 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArxO35085 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArxO35085 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArxO35085 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArxO35085 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArxO35085 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArxO35085 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArxO35085 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArxO35085 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArxO35085 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArxO35085 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArxO35085 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArxO35085 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArxO35085 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ArxO35085 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArxO35085 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArxO35085 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArxO35085 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArxO35085 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArxO35085 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArxO35085 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArxO35085 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArxO35085 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArxO35085 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArxO35085 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArxO35085 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArxO35085 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArxO35085 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ArxO35085 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArxO35085 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArxO35085 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArxO35085 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArxO35085 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArxO35085 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ArxO35085 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ArxO35085 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ArxO35085 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ArxO35085 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ArxO35085 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ArxO35085 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ArxO35085 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ArxO35085 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ArxO35085 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ArxO35085 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ArxO35085 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ArxO35085 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ArxO35085 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ArxO35085 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ArxO35085 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ArxO35085 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ArxO35085 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ArxO35085 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ArxO35085 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ArxO35085 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ArxO35085 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ArxO35085 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ArxO35085 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ArxO35085 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ArxO35085 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ArxO35085 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ArxO35085 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ArxO35085 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ArxO35085 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArxO35085 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArxO35085 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ArxO35085 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArxO35085 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArxO35085 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArxO35085 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ArxO35085 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArxO35085 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArxO35085 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArxO35085 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArxO35085 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArxO35085 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArxO35085 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArxO35085 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArxO35085 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArxO35085 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArxO35085 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ArxO35085 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ArxO35085 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ArxO35085 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ArxO35085 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ArxO35085 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ArxO35085 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ArxO35085 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ArxO35085 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArxO35085 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArxO35085 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArxO35085 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArxO35085 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArxO35085 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArxO35085 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms