Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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