Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Degs1O09005 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Degs1O09005 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Degs1O09005 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Degs1O09005 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Degs1O09005 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Degs1O09005 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Degs1O09005 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Degs1O09005 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Degs1O09005 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Degs1O09005 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Degs1O09005 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Degs1O09005 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Degs1O09005 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Degs1O09005 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Degs1O09005 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Degs1O09005 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Degs1O09005 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Degs1O09005 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Degs1O09005 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Degs1O09005 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Degs1O09005 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms