Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms