Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms