Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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