Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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