Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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