Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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