Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21411J3KMS0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21411J3KMS0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21411J3KMS0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21411J3KMS0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21411J3KMS0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21411J3KMS0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21411J3KMS0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21411J3KMS0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gm21411J3KMS0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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