Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc4lG5E8X2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc4lG5E8X2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc4lG5E8X2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc4lG5E8X2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc4lG5E8X2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc4lG5E8X2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc4lG5E8X2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc4lG5E8X2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc4lG5E8X2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc4lG5E8X2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms