Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp17lcG5E8I7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp17lcG5E8I7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp17lcG5E8I7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp17lcG5E8I7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp17lcG5E8I7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp17lcG5E8I7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms