Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r12G5E8G1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms