Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms