Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms