Protein–RNA interactions for Protein: G3X946

Gm4847, Flavin-containing monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4847G3X946 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm4847G3X946 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4847G3X946 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms