Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms