Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms