Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ercc6F8VPZ5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ercc6F8VPZ5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ercc6F8VPZ5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ercc6F8VPZ5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ercc6F8VPZ5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ercc6F8VPZ5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ercc6F8VPZ5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ercc6F8VPZ5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ercc6F8VPZ5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ercc6F8VPZ5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ercc6F8VPZ5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ercc6F8VPZ5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ercc6F8VPZ5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
Ercc6F8VPZ5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
Ercc6F8VPZ5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ercc6F8VPZ5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ercc6F8VPZ5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ercc6F8VPZ5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms