Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms