Protein–RNA interactions for Protein: F7BE84

Ankrd50, Ankyrin repeat domain 50 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd50F7BE84 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd50F7BE84 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd50F7BE84 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd50F7BE84 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd50F7BE84 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd50F7BE84 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd50F7BE84 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd50F7BE84 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd50F7BE84 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ankrd50F7BE84 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ankrd50F7BE84 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd50F7BE84 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd50F7BE84 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd50F7BE84 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd50F7BE84 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd50F7BE84 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd50F7BE84 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd50F7BE84 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd50F7BE84 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd50F7BE84 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd50F7BE84 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd50F7BE84 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd50F7BE84 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd50F7BE84 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd50F7BE84 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd50F7BE84 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd50F7BE84 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd50F7BE84 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd50F7BE84 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms