Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms