Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms