Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Crocc2F6XLV1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms