Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17093F6XGJ4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17093F6XGJ4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17093F6XGJ4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17093F6XGJ4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17093F6XGJ4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17093F6XGJ4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17093F6XGJ4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17093F6XGJ4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17093F6XGJ4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17093F6XGJ4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17093F6XGJ4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17093F6XGJ4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17093F6XGJ4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17093F6XGJ4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17093F6XGJ4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17093F6XGJ4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17093F6XGJ4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17093F6XGJ4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17093F6XGJ4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17093F6XGJ4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms