Protein–RNA interactions for Protein: F6WIE4

Gm10563, Predicted gene 10563, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10563F6WIE4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm10563F6WIE4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm10563F6WIE4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms