Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5861F6VCN9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm5861F6VCN9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms