Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pagr1bF6V0H0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1bF6V0H0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms