Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms