Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms