Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms