Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc146E9Q9F7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc146E9Q9F7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc146E9Q9F7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc146E9Q9F7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms