Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col22a1E9Q7P1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms