Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms