Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms