Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pgbd1E9Q492 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pgbd1E9Q492 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms