Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms