Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
5430401F13RikE9Q328 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms