Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc4E9Q236 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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