Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
6430550D23RikE9Q1X6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
6430550D23RikE9Q1X6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms