Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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